10bp
DNA ladder
● 產(chǎn)品編號及規(guī)格:
RTM443
50次 (250 μl)
● 產(chǎn)品組成:
貨號
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名稱
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規(guī)格
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RTM443-01
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10bp DNA ladder
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50次(250 μl)
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DL070-01
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6×Native-PAGE DNA上樣緩沖液
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1 ml
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● 產(chǎn)品簡介:
本產(chǎn)品是由8條帶狀雙鏈DNA條帶組成的精準定量Marker,8條帶的大小分別為10,15,20,25,30,40,50,100bp。其中25 bp條帶為加亮帶,含量為100 ng/5 μl,其余條帶濃度為50ng/5μl。本產(chǎn)品為雙鏈DNA Marker,適用于非變性的PAGE電泳,不適用于尿素PAGE電泳。由于片段長度很短,不建議用瓊脂糖凝膠電泳分離。
按照每次上樣5μl計算,該產(chǎn)品可以使用50次。
● 儲存、效期及運輸條件:
-20℃ 貯存;有效期3年;濕冰運輸。
● 使用方法:
一、 TBE-PAGE凝膠分離:
1、制備凝膠步驟:
1.1參照凝膠模具說明書,裝配好凝膠模具。
1.2按照表一將不同體積的成分在小燒杯或試管中混合;最后加入10%APS和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免產(chǎn)生氣泡。
注:10 bp DNA ladder 適用于配制20%TBE-PAGE膠。
1.3在凝膠模具中灌入適量分離膠溶液(對于mini-gel,凝膠液加至約距前玻璃板頂端1.5 cm或距梳齒約0.5 cm即可),然后在分離膠溶液上輕輕覆蓋一層1-2 cm的無水乙醇,使凝膠表面保持平整。
1.4靜置10-20分鐘,待分離膠和乙醇層之間出現(xiàn)一個清晰的界面后,說明凝膠已聚合
表一 TBE-PAGE分離膠配方表 (總體積5 ml,適用于1mm厚度小板膠)
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各組份體積(ml)
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最佳DNA分離范圍
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凝膠濃度
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滅菌水
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30%PAA(29:1)
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5×TBE
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10%APS
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TEMED
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70-450 bp
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6%
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3
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1.0
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1.0
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0.05
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0.005
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60-460 bp
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8%
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2.66
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1.34
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1.0
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0.05
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0.005
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50-300 bp
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10%
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2.33
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1.67
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1.0
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0.05
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0.005
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40-200 bp
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12%
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2
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2.0
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1.0
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0.05
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0.005
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25-150 bp
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15%
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0.5
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2.5
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1.0
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0.05
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0.005
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5-100 bp
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20%
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0.66
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3.34
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1.0
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0.05
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0.005
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1.5去除覆蓋在分離膠上的乙醇;按照表二將不同體積成分在一個小燒杯或試管中混合;最后加入10%過硫酸銨和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免產(chǎn)生氣泡。
表二 TBE-PAGE 4%濃縮配方表 (總體積1.5 ml,適用于1mm厚度小板膠)
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各組份體積(ml)
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凝膠濃度
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滅菌水
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30%PAA(29:1)
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5×TBE
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10%APS
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TEMED
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4%
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1.0
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0.2
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0.3
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0.02
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0.002
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1.6將濃縮膠溶液加至分離膠的上面,直至凝膠溶液到達前玻璃板的頂端;將梳子插入凝膠內(nèi),避免產(chǎn)生氣泡。
1.7靜置30-60分鐘,等待濃縮膠聚合。
注:凝膠的聚合時間與環(huán)境溫度有關(guān)。夏天溫度較高時,聚合較快;冬天氣溫低時,聚合時間會延長??梢愿鶕?jù)環(huán)境溫度的不同調(diào)節(jié)APS的加入量。
2、電泳:
2.1 將凝膠板固定在電泳裝置上,往上槽和下槽中加入1×TBE電泳液,1 ml吸頭沖洗加樣孔1-2次。
2.2 取待測樣品,加入相應(yīng)體積6×Native PAGE DNA上樣緩沖液,如5 μl樣品加1 μl 上樣緩沖液,短暫離心后取5-10 μl上樣。 10 bp
DNA ladder 1 mm厚10齒梳子上樣5 μl,其余梳齒和厚度凝膠適量調(diào)整上樣量。
2.3 連接電源線,打開電源開關(guān)。200 V穩(wěn)壓電泳,至溴酚藍指示前沿距離玻璃下沿1 cm時結(jié)束電泳。
TBE-PAGE電泳
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恒電壓
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起始電流
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結(jié)束電流
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電泳時間
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200
V
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20-25 mA/板膠
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10-15
mA/板膠
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50+min
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20%T3.3C TBE-PAGE
3、染色:
3.1 漂洗:玻璃板上拆下凝膠后,適量蒸餾水漂洗3-5分鐘。
3.2 染色液配制:
TBE-PAGE膠可以使用EB或RealSafe類染料后染染色,以下程序用RealSafe Red核酸染料(貨號:GR002)進行染色。即用型染色液配制:
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即用型RealSafe核酸染色液
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100 ml
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1×TBE
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100 ml
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RealSafe Red核酸染料
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20 μl
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3.3染色和觀察:
凝膠浸泡于即用型染色液中,常溫避光搖床40-60 rpm染色30 分鐘。紫外光下觀察。
4、實驗示例:
20%TBE-PAGE電泳
左1-7:10,15,20,25,30,40,50
bp
右1:10
bp DNA ladder
凝膠長度8 cm
電壓200 V 起始電流25
mA,終止電流13 mA
電泳緩沖液:1×TBE
電泳時間:50分鐘
染色:RealSafe Red核酸染料后染30分鐘
使用RTM443 10bp DNA ladder產(chǎn)品發(fā)表部分文章列表:
1. [2021 IF=8.025] A method for
high-concentration agarose gel preparation and its application in high-resolution separation of low-molecular-weight nucleic acids
and proteins.
Marker :RTM443,10bp DNA ladder
Author: Lili
Chang , Dan Wang, Cunzhi Peng, Qi Wang, Bingqiang Xu, Zheng Tong
Journal: International
Journal of Biological Macromolecules 231 (2023) 123358
Institution:Key
Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropical Crops, Institute of
Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural
Sciences
Paper
link:https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2023.123358
2. [2022 IF=6] A novel fuorescent sensor
based on aptamer recognition and DNA walker amplication strategy and its determination of 17b-estradiol.
Author: Yajun Zhang, Licong Jia, Wei Wang, Meng Jiang, Hongying Zhang,
LingMei Niu
Marker: RTM443,10bp DNA ladder
Journal: Arabian Journal of Chemistry. 16 (2023) 105340.
Institution:School
of Public Health, Hebei Medical University
Paper link:https://doi.org/10.1016/j.arabjc.2023.105340